Взяття біологічного матеріалу, по можливості, повинно проводитися в період загострення інфекції.
Для контролю ефективності терапії взяття біоматеріалу проводиться не раніше, ніж через 4-6 тижнів після закінчення лікування. (прийом препаратів узгоджується з лікарем, про прийом препаратів інформується медична сестра до забору матеріалу). Чоловікам необхідно утриматись від сечовиділення 2-3 години до взяття матеріалу (це правило актуальне для жінок,якщо планується взяття матеріалу з уретри).
• Перед здачею біоматеріалу з урогенітального тракту не можна:

• жити статевим життям менш ніж за 36 годин до взяття матеріалу;
• застосовувати дезінфікуючі розчини;
• використовувати антибактеріальне мило;
• застосовувати антибактеріальні засоби або септики всередину;
• жінкам застосовувати будь-які вагінальні свічки менше, ніж за 36 годин до взяття матеріалу;
• жінкам спринцюватися;
• жінкам здавати аналізи під час менструації.

Сперма
Матеріал збирається в стерильний аптечний контейнер в стінах медичного центру або вдома. Якщо є вживання антибіотиків, протигрибкових чи протимікробних препаратів - їх відміняються за 14 днів до збору матеріалу, якщо лікаря не каже протилежне.